순환 기관은 산소, 영양 물질 및 호르몬 등을 몸의 각 부분에 운반하는 한편 체내에서 생긴 노폐물을 배설 기관까지 운반하는 일을 맡고 있다. 일반적으로, 척추동물은 순환 기관이 혈관계(vascular system)와 임파계(lymphatic system) 로 되어 있으나 어류의 경우 임파계는 발달되어 있지 않다.

어류의 심장은 1 심방 1심실로 되어 있으며, 심장을 중심으로 동맥, 모세혈관, 정맥으로 되어 있는 폐쇄 손환계를 형성하고, 그 속에서 혈액이 순환한다. 즉 몸속에서 돌아온 혈액은 등 대동맥을 거쳐 아가미로 보내어진다. 아가미 속에서는 혈액 속의 이산화탄소와 물 속의 산소와 교환되어 동맥피로 만들어지고 아가미 위쪽으로 모안 혈액은 복부 대동맥을 지나 심장에 모인 후, 동맥에 의맥구(bulbus arterio년) 의 율동적인 운동의 힘으로 혈액을 흐르게 하며, 동맥구와 심실 사이에는 판막이 있어 혈액이 거꾸로 흐르는 것을 방지한다.