생물학적 평가지표는 환경부가 내놓은 개선안에 따르면 특정한 환경에서만 서식하는 생물종을 이용해 수질 등급을 평가한다.
1a등급(최적):지표종으로 산간 계곡수에 살고있는
버들치,금강모치,갈겨니
1b등급(청정):쉬리,쏘가리,돌고기,꺽지 등
2 등급(양호):돌마자,송사리,모래무지,긴몰개
3 등급(보통):피라미,끄리,미꾸라지
4 등급(불량):붕어,잉어,치리
5 등급(최악):어류 거의 존재하지 않음
<자료:환경부>